在超纯水机长期使用过后的一段时间若是突然需要停运闲置一段时间，对于设备来说，操作人员仍要进行一定的保养，否则设备再次启动很有可能导致设备水质发生变化。
因为超纯水机的内部结果有着多级过滤连接而成，从预处理到ro，再到纯水箱，离子交换以及后级处理工艺全是连接在一块的，设备若是长时间的闲置会在各种处理单位以及管道中滋生细菌，长此以往的话就很难有效去除，设备长久闲置很有可能会让设备管道内的菌落数超标。之后的处理工艺以及滤芯也都不能在维护状态下长久闲置，超纯水机在长期无用的状态下，需要定期对超纯水机内部进行运行清洗，这样才能让膜表面的污垢得到清楚，还能够让离子交换法的树脂表面不受到空气中污染物的影响。并且超纯水机若是需要闲置更长时间建议联系生产厂家对于零件进行周期性的维护保养，对超纯水机的滤芯、膜元件开展清洗防垢的方案。
另一方面，污垢在细小微粒中，胶体溶液以及金属材料沉淀会粘附于滤芯的表面，反渗透膜是超纯水机重要的处理元件之一，为了防止超纯水机有垢的关键原因在于预处理系统的工作，预处理设备需要去除部分大型的源水杂质才能够给反渗透膜进行处理，这样能够大幅度增加反渗透膜的寿命，防止反渗透膜的管道以及滤芯产生积垢。同时艾柯超纯水机还附带反清洗系统，清洗反渗透膜的杂质，进一步加强反渗透膜的使用寿命以及水质稳定。
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